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从基因组到蛋白质组 - 分子生物学家们的新爱好

2001年11月12日

人类基因组之谜已经解开,但是对生物学家来说,这还不够。他们还想知道,由这些基因所组成的细胞,都生产哪些蛋白质。他们将其称之为蛋白质组,这是英文蛋白质和基因组的组合。

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电脑模拟蛋白质分子图像来源: AP
基因组只能说明一个微生物可以做些什么,而蛋白质组却可以显示一个细胞能做些什么。这也就是说,某个细胞是生产什么样的物质代谢产品的,这种产品对细胞完成其各自的任务起着决定性作用。比如神经细胞里的蛋白质就和肝里的不一样,癌症细胞里的又和健康细胞中的不同。目前的科研技术,已经可以利用一种所谓凝胶,把一个细胞所含有的蛋白质分子分离开来,也就是在一张信纸大小的薄膜上,所有这些蛋白质分子各占一个小点。问题在于,有些细胞可以含有1万个、甚至更多的蛋白质分子,也就是说经常会发生蛋白质重叠现象。相应地,科学家便难以进行准确分析,做出可靠的结论。 后来科学家们发现,一个细胞所含的蛋白质数量可能会太多,以至于一种凝胶不够用。人们尝试了不同的途径,来解决这一问题。对真核细胞,也就是动物或植物细胞而言,解决办法相对简单,因为可以根据不同器官予以事先分类。而在细菌细胞的情况下就比较复杂,至今有不同的解决方法。一种是利用各个蛋白质的不同溶解度,先在一种凝胶上溶化易于溶水的蛋白质,随后再用另一种带有清洁剂的凝胶,溶解难于溶水的蛋白质分子。我们所发明采纳的另一种方法,是先将细胞粗略分离。 科学家先将细胞壁和细胞内部的蛋白质分离开来。就是一个细胞的核,也有它自己的蛋白质。这样的话,至少每一次分析“只”要管几百个蛋白质就行了。当然,科学家们也想知道,它们各自究竟是哪一种物质交换产品。在此,源于有机化学的一种分析手段派上了大用场。 质谱仪分析法 质谱仪法是一种灵敏度很高的分析方法。利用这一方法,也可以非常准确可靠地辨别和分析蛋白质,其精确度可达毫微微摩尔,有时甚至更高。 毫微微摩尔的精度,意味着即使一种蛋白质在一个细胞中只出现一到两次,也可以被分析辨认出来。在进行质谱仪分析法时,等于是将一个细胞根据其自然构造,分解成几块,然后再分析每一块的质谱。科学家们可以根据以此获得的信息,非常准确地推论出初始细胞是什么样的。质谱仪法已经开始被用在医学上,因为它一次就可以分析出一系列的蛋白质,而这种优势有时是非常有用的。 质谱仪分析法的优势 比如说,在诊断过敏症时,医疗保险公司最多只承担5个测验点的费用。但是假如医生需要20个或者30个测验点的话,病人就得自己掏钱,或者他必须投私人医疗保险公司的险,以便报销所有费用。使用质谱仪法诊断过敏症的话,医生就可以同时考虑很多额外的、但可能也有一定影响的因素。 许多其他科研小组,都在研究开发可以同时进行20到30种测验的所谓蛋白质芯片。这些测验也可以用来预告某种疗法的治疗效果,科学家们可以研究服用某种药物之后,一定的蛋白质会发生怎样的变化。在基因诊断法中,已经应用了芯片技术,在一个信用卡大小的面积上,置有成千个测验点。但是,就目前来说,一个芯片上就包含有一个细胞的所有蛋白质分子,这一设想还只是一个美好的未来蓝图。